臺灣目前商業栽培的木耳主要為毛木耳的兩個品系──黑耳、紅耳。紅耳適合於18~25℃出菇生長發育，主要在9月中旬至隔年2、3月栽培，黑耳適合於23~30℃，主要在9月初至隔年3、4月栽培 [註01]。點此看更多：木耳家族

木耳栽培大致上可分成段木天然植培法及木屑太空包栽培法，臺灣目前以木屑太空包栽培法為主。[註01]

• 段木天然植培法（照片來源：陳美杏博士）

  木屑太空包栽培法（照片來源：農業部農業試驗所石信德研究員）

1.菌種採集與培養
從新鮮木耳上採集組織或孢子，將其培養成菌種，經過檢定確定為優良菌種後，才可進行栽培生產。[註01]

2.木屑太空包製作
以多種樹種製成的木屑，混雜米糠、黃豆粉、碳酸鈣等配方，加水進行均勻混合，使含水量為60%~65%，填入太空包後封口，接著進行殺菌作業。[註01]

3.太空包內接種
接種人員應換穿乾淨的工作服、進行手部消毒，並以消毒過的接種匙將菌種挖鬆，將菌種接入太空包中。[註01]

4.太空包培養菌絲
將太空包移到菇舍，整齊排放在床架上，等待菌絲成長。菇舍須保持遮光及通風良好的狀態，溫度控制在22~28℃，濕度為70~80%。[註01]

5.太空包開包管理
等到菌絲長到九分滿或全滿時，將太空包割開；隨著子實體發育長大，噴霧灑水量和通風量要加大，並給予適當的光照。[註01]

6.採收
開包後約3-4週即可採收，採收後間隔約1個月，即可再次採收，共計可採收4~5次。黑耳採收後通常以新鮮狀態販售，紅耳則以曬乾狀態出售。[註01]

註01：臺灣農家要覽增修訂三版-農作篇（二），農業部編著，2005年。