檸檬品種眾多，台灣市場及飲料調製使用的檸檬以綠皮的四季檸檬最為常見，而歐美國家則以黃皮之四季檸檬為大宗，四季檸檬具濃烈香氣，果肉呈淡黃色，且具有種籽，
而與檸檬相像的萊姆，在臺灣栽培之品種為大溪地萊姆，其果皮薄，果肉呈黃綠色，果汁率高，酸味明顯，但香氣較檸檬淡一點。花藥上無花粉，因無籽，所以又被稱無籽檸檬，俗稱青檸。
黃金檸檬，為橙類與枸櫞雜交，酸度較低，但檸檬味道淡，香氣偏柚類。
香水檸檬，耐貯運，又具檸檬清香，且結果性強，全年結果，現多做為園藝栽培的觀果植物。果肉可切片放入冷開水中，使飲水具有檸檬香味但不致過酸，或是切片製成檸檬果乾。
資料來源:農業試驗所 陳祈男助理研究員